Melalui sertifikasi kompetensi yang diterbitkan oleh Badan Nasional Sertifikasi Profesi (BNSP), BIFL juga membekali mahasiswa dengan kompetensi khusus. Sertifikasi ini dikelola oleh Lembaga Sertifikasi Profesi (LSP) UMM, yang dapat digunakan oleh lulusan sebagai tambahan kompetensi yang sering dibutuhkan ketika mencari pekerjaan. Ada lima skema kompetensi yang telah terverifikasi, yaitu:

1. Skema Juru SembelihHalal,
2. Skema Amil Zakat Dasar,
3. Skema Manajer Amil Zakat,
4. Skema Jaminan Produk Halal,
5. Skema Penerimaan Harta Wakaf.

Kelima skema ini merupakan program unggulan yang hanya ada di BIFL UMM dan tidak dimiliki oleh program studi serupa di universitas lain di Indonesia.